본 발명은, EMR 데이터베이스로부터 약물이 투여된 환자 또는 시술이 실시된 환자를 선택하는 단계; 약물이 최초로 투여되거나 시술이 최초로 실시된 최초 시점을 확인하는 단계; 최초 시점을 기준으로 약물 투여전 대표값(PreECG) 및 약물 투여후 대표값(PostECG) 또는 시술전 대표값(PreECG') 및 시술후 대표값(PostECG')을 결정하는 단계; 및 통계 검증을 통해 약물 또는 시술의 부작용 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 전자 의무 기록 및 심전도 데이터를 이용한 약물 또는 시술 부작용 감지 방법에 관한 것이다.