본 발명의 전자 의무 기록을 이용한 후향적 코호트 연구 기반의 약물 부작용 실마리 감지 방법은 (a) 부작용 여부를 파악하고자 하는 약물 및 부작용 여부를 파악하는 검사를 결정하는 단계; (b) EMR(전자 의무 기록; electronic medical record) 데이터베이스로부터 상기 약물 노출군과 약물 비노출군 후보를 추출하는 단계; (c) 상기 약물 노출군과 상기 약물 비노출군 후보를 주요 변수에 대하여 매칭하여 약물 노출군과 약물 비노출군을 선정하는 단계; (d) 상기 약물 노출군 환자들의 검사 결과 중 약물 투여후 대표값(PostLab) 및 상기 약물 비노출군 환자들의 검사 결과 중 약물 비투여 대표값(NoLab)을 결정하는 단계; 및 (e) 상기 약물 투여후 대표값(PostLab) 및 상기 약물 비투여 대표값(NoLab)의 통계 검증을 통해 상기 약물의 부작용 실마리 여부를 결정하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.