본 발명은 예후가 좋지 않은 간내담도암 환자와 호전된 예후를 보이는 간내담도암 환자의 794개 쓸개세관 분화 시그니처(cholangiolar differentiation signature, CD signature)의 발현 차이를 확인한 것으로, 본 발명에 따르면 CD 시그니처는 ICC 서브유형 간에 발현 차이를 보일 뿐만 아니라, 쓸개세관 췌장관 분화 시그니처(cholangiolar pancreatic duct differentiation signature, CP signature)보다 더 특이적으로 ICC의 예후 서브유형을 진단할 수 있음을 확인하였으므로, 상기 유전자, 또는 상기 유전자로 엔코딩된 단백질을 독립적 또는 병합으로 간내담도암 예후 예측용 바이오 마커로 사용할 수 있다.