본 발명은 나노입자의 신경독성 여부 진단용 바이오마커 조성물에 관한 것으로서, MNPs@SiO 2 (RITC)와 같은 나노입자는 세포내 폴리아민 대사체, 예를들어 푸트레신은 증가시키고 스페르미딘과 스페르민은 감소시키며, 또한 폴리아민의 대사와 관련된 유전자인 ODC1, SAT1, PAOX 및 SRM1의 발현을 증가시켜 봉입체 형성을 증가시키고 신경 부전을 야기할 수 있는 바, 나노입자에 의한 세포내 응집체 형성을 통한 나노신경독성을 판단하는 지표로서 폴리아민 대사체 및 폴리아민 대사와 관련된 유전자를 이용하여 나노 신경독성 생지표를 제공할 수 있다.